某些瓣膜疾病可以藉由藥物治療減輕心臟負擔，並改善心臟功能。藥物治療多為症狀治療，若心臟瓣膜結構已經受損，就難以靠藥物根除。

隨著科技進步，近年來也發展出導管治療技術。與外科手術相比，不需切開胸骨、也不用停止心跳，利用細長的導管經過周邊的血管到達心臟進行治療，傷口較小，手術後所需要的恢復時間更短，但並非適合治療所有的心臟瓣膜疾病。